下痢的原因很多，最重要的有下列幾點：

1. 飼養管理失宜：飼料品質不良、餵太多、營養失調等，其他畜舍設備不良、受涼等也會引起下痢。
2. 因細菌感染引起：最普遍者如大腸楊菌、沙氏桿菌等是重要病因。
3. 病毒感染引起：豬傳染性胃腸炎病毒等。 由於原因很多，並非餵農會飼料或添加歐羅肥即不發生下痢，如因病毒性的下痢，到目前為止沒有特效的藥物可以治療。