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一、	利用傳統技術提升生產效率
	1.	畜禽新品種及品系開發與應用：國內羊隻活體拍賣市場趨向於黑毛色、體型大、屠宰率及精肉率高、脂肪率低、腥羶味少的優質肉羊，本場以努比亞公羊與本地母黑山羊雜交一代自交選育黑毛肉羊，以期育成黑毛而體型大，可全年配種與產仔數多，及產肉高的肉羊，以符市場的需求。
	2.	高品質芻料作物之生產、調製與利用：強化地區性高品質芻料作物生產與利用，本場已具有芻料作物栽培管理及調製優質芻料之相關技術，並致力於輔導農民生產品質良好且穩定的牧草，建立地區性芻料生產體系，以全年穩定供應，並協助總所飼料作物組進行牧草新品系選育與推廣。
	3.	研發本土環境及消費導向畜禽生產模式：開發地區性畜禽產品，利用水牛代表的文化意涵，發展以水牛為主之生態休閒教育農業園區，結合區域產業發展，生產無污染、健康、有機綠色畜產品－水牛肉，開發消費者歡迎的地方性特產，當可創造出傳統畜產農業轉型的契機，期開發永續水牛產業。水牛目前的用途除肉用及小部分役用之外，隨著休閒與精緻化產業的蓬勃發展，許多休閒產業期望發展具有文化內涵的產業特色，「拉車」為最直接的呈現方式，本場挑選溫馴的水牛，進行役用訓練，從事拉曳重物及拉車載運乾草、飼料，將該訓練技術繼續傳承，使水牛拉車的景象不致在台灣消失。為重現傳統農村社會水牛與農村生活密不可分的寫實景象，未來花蓮地區水牛產業風貌，將以具有地方特色的水牛飼養區與週邊產品的開發為主，結合觀光與休閒活動，創造水牛文化新意涵。並建立以努比亞公羊與本地母黑山羊雜交一代自交選育的黑毛肉羊，選育另一黑羊品種，建立規格化生產制度，期以另一種以品質為訴求的肉羊，與進口羊肉做區隔，開發地區性及消費者導向畜產品，提供消費市場的選擇。
二、	運用生物科技促進產業升級
	1.	禽畜基因庫建立與應用：花蓮種畜繁殖場為台灣水牛與黑山羊之種原保存基地，未來仍將維持保種畜群，收集基礎資料，以利種原資料庫建立。
	2.	遺傳資源活體與冷凍保存及應用：冷凍保存台灣水牛與黑山羊之生殖細胞與建立人工生殖復育技術，並建立民間保種畜群，以達分散保種目的。
三、	畜產知識傳播
	1.	優良種畜與牧草推廣：本場亦進行台灣水年、黑山羊、雜交山羊、肉仔豬、二品種女豬及牧草肥育與育成試驗，期望提升生產效率，增加農民飼養意願，並將種原推廣至民間，以減緩保種動物在養頭數日漸減少之趨勢及分散種原的目的。
	2.	產銷班與畜牧團體輔導及生產新技術推廣：透過參與產銷班與畜牧團體會議及舉辦學術研討會，協助業者解決與反應問題及傳播生產新技術。

◎	水牛
	1.	冷凍保存台灣水牛、黑山羊種原生殖細胞、體細胞、DNA，以利未來遺傳質之保存與特質研究，並建立人工生殖技術。
	2.	完成台灣水牛精液性狀調查：精液量：2.0 ± 0.5mL、精子濃度：1.4 ± 0.3 × 109 sperms/mL、泳動性評分：4.6 ± 0.4、精子活動力：82.2 ± 6.0%、精子畸形率：7.0 ± 1.5%、死精子率：8.8 ± 3.2%、pH值：6.6 ± 0.1。精子之活動力與濃度等精液性狀以冬季為最佳，可於該季節進行精液冷凍保存作業。
	3.	製作台灣水牛冷凍精液時，可於30℃下，將精液先以不含甘油之稀釋液稀釋，再添加含甘油稀釋液後，進行裝填與封口，緩慢降溫至5℃後，經2小時的平衡時間，再進行冷凍過程，可得較佳之冷凍-解凍後，於37℃培養0和3小時之精子活動力與低滲透壓膨脹試驗所測試之精子膜功能的完整性，而其冷凍精液解凍後的人工授精受胎率為50﹪。
	4.	母水牛以PGF2α兩劑間隔11天注射，進行發情同期化，誘使母牛發情之比例達85.7﹪，為一可用的發情同期化方式，若搭配輸精管結紮的試情公牛進行發情偵測，可有效偵測母水牛發情達80﹪，此方法可以解決水牛發情不明顯之困難，利於水牛人工授精作業。
	5.	台灣水牛胚移置技術之研究：研究目的：建立台灣水牛人工生殖復育技術，確保台灣水牛不致滅種。已進行超級排卵處理供胚牛23頭次，超排反應率60 %，平均黃體數5.5個/頭；4頭供胚牛於配種後第5.5天以法式沖胚器進行非外科手術法沖胚，沖胚液回收率95 ﹪，共收集到8顆牛胚（2顆退化、4顆囊胚及2顆桑椹胚）， 1顆進行移置，另5顆先行凍存。
	6.	女水牛行為調查結果顯示，熱、涼兩季中，四種行為於一日中所花費時間的比例分別為：採食24.8﹪ vs. 26.6﹪，水浴12.7﹪ vs. 0﹪，站立與活動21.2 ﹪vs. 25.8﹪，躺臥41.3﹪ vs. 41.3﹪。熱季時，採食行為發生於白天比例為65.04﹪至69.04﹪，冬季則為83.19至87.94﹪。
	7.	建立肉用水牛肥育模式，減少飼養時間及提早在年輕時（即18至20月齡）屠宰上市，也增加了牛肉生產量(體重平均多80~120 kg)，並且改善牛肉的品質，提高上市體重，節省肉用水牛育成飼養成本。
	8.	水牛屠體調查結果，屠宰率51.2﹪、精肉率36.0﹪、脂肪率（佔屠體重）15.3 ﹪、腰眼面積85cm2、背脂厚度為1.5公分、Marbling Score：2。
	9.	水牛拉役450kg的牛車另承載0~800 kg時，行進速度介於49.3 - 58.6 m/min，而馬力及作功隨著負重增加而增加。
◎	山羊
	1.	應用分子生物技術檢測本場台灣黑山羊之G6S基因遺傳型（山羊黏多醣症），以避免肉羊飼養時之經濟損失，結果顯示本場之羊隻均為正常型100%。
	2.	完成台灣母土山羊繁殖性狀調查：全年性配種率以10、3月份最高（35﹪、32%），以1、7、8、9月份最低（0﹪），其他月份配種率依序為5月(14%)、6月(6%)、11月(6%)、4月(4%)、12月(2%)、2月(2%)。季節性(10~11月)配種率可達85%以上。單胎率為21.6%、雙胎率67.6%、三胎率8.1%、四胎率2.7%，平均產仔率為190%。仔羊出生平均體重為1.79 ± 0.45 kg（公2 kg；母1.6 kg），3月齡離乳體重為9.0 ± 2.4 kg，平均日均重80 g。
	3.	完成台灣黑山羊精液性狀調查：精液外觀呈乳白色、精液量介於0.4~1.5 ml、pH介於5.4~7.3、活動力2~5分、活動力介於10~80%、濃度介於3.7~14.48x 109/ml; 精子畸型率為0.43~2.34%;死精子比率為6.23~24.14%。
	4.	利用努比亞山羊與土山羊兩品種之血緣關係甚遠，及努比亞羊在生長率、多產性及體型大等特性，進行黑色肉羊之改良。雜交羊F1代體型表現良好，但其黑毛率不高，利用雜交F1代進行自交，可使後裔羊隻黑毛呈色率增加。目前以評分選拔後裔羊群，可建立高黑毛率之大型黑羊族群，並推廣至市場，以增加養羊戶之收益。經屠體試驗調查，12月齡閹公羊體重35公斤，平均之屠宰率可達54%，精肉率(佔屠體)65.3% (佔活體重的41.8%)，體脂肪率低5.69% (屠體脂重＋體腔脂重/活體重)，符合市場高精肉產量及低脂健康肉品之需求。
◎	牧草
	1.	尼羅草之地區性選育：協助尼羅草台畜草一號完成品種命名工作，選育高產優質之品種，提供農戶優質芻料多元選擇。
	2.	輔導建立地區性芻料穩定供應體系：推廣種植狼尾草台畜草二號，輔導農民經由適當的栽培管理及收穫調製方法，提高芻料品質與利用效能，協助進行自產與外購芻料品質監測及適時調整飼糧配方，輔導建立芻料穩定供應體系，提昇產品品質及產業競爭力。
	3.	狼尾草育種：協助總所飼料作物組進行狼尾草高纖維消化率品系選育。
	4.
◎	輔導轄區內三段式畜牧廢水處理設施設置98%以上；95年度輔導轄區內三段式畜牧廢水處理設施管理操作及改善2戶。


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